W 1948 roku władze ZSRR zwróciły się̨ do władz Polski z prośbą̨ o przyjęcie 3500 dzieci z Grecji pogrążonej w wojnie domowej. Dzieci przybyłe do Polski były dwóch narodowości: greckiej i macedońskiej.
Wśród tych dzieci był 9 letni ojciec autora filmu. Po wojnie władze w Atenach odebrały zbiorowo dzieciom obywatelstwo i zakazały powrotu do domu. Akt ten był i jest niezgodny z Konwencją Praw Człowieka. 76 letni dziś bohater filmu wciąż ma odebrane obywatelstwo i zakaz powrotu do domu.
Akcją filmu jest wyjazd reżysera jako syna bohatera do Grecji w poszukiwaniu jego domu rodzinnego. Film posiada wyjątkowe, nieznane w Polsce materiały archiwalne. „Macedończyk” opowiada o tęsknocie za domem, o złamaniu praw człowieka w środku Europy oraz o wdzięczności Polsce.